Ichtyoplancton

Une des méthodes standard en halieutique est le suivi de l'ichtyoplancton. Elle est utilisé pour estimer la taille d'un stock reproducteur à partir du nombre d'œufs ou de larves produit (par exemple, Rankine et Bailey 1987). Une condition préalable nécessaire à de telles études est la capacité d'identifier les œufs et les larves de poisson. Il a été montré qu'en général, les systèmes informatisés, en particulier les bases de données, peuvent faciliter cette tâche (Froese et Schöfer 1987 ; Froese 1988, 1989 ; Froese et al. 1989, 1990 ; Froese et Papasissi 1990 ; Froese 1990b). De plus, les caractères morphologiques des œufs et des larves peuvent être utilisés pour tester des hypothèses au sujet de stratégies de vie (par exemple, Froese 1990a).

Nous avons longtemps cherché une institution qui prendrait la responsabilité de la mise à jour et du développement futur de nos tables ichtyoplancton actuelles décrites ci-dessous. L'Institut für Meereskunde, Kiel, Allemagne, a initié LarvalBase, une version substantiellement plus élaborée des tables ichtyoplancton de FishBase. Si vous êtes intéressés pour collaborer à LarvalBase, veuillez visiter http ://www.ifm.unikiel.de/fi/bu/larvalbase/homepage_1.htm ou contacter le Projet FishBase.

Références

Froese, R. 1988. The use of quadratic discriminant functions in connection with video-based measurements for identification of fish larvae. ICES C.M. 1988/L : 11, 8 p.

Froese, R. 1989. Computer-aided approaches to identification. II. Numerical taxonomy. Fishbyte 7(3) : 25-28.

Froese, R. 1990a. Growth strategies of fish larvae. ICES C.M. 1990/L : 91, 20 p.

Froese, R. 1990b. Moderne Methoden zur Bestimmung von Fischlarven. Universität Hamburg. Thèse de Doctorat. 260 p.

Froese, R. et C. Papasissi 1990. The use of modern relational databases for identification of fish larvae. J. Appl. Ichthyol. 6 : 37-45.

Froese, R. et W. Schöfer 1987. Computer-aided identification of fish larvae. ICES C.M. 1987/L : 23, 10 p.

Froese, R., W. Schöfer, A. Röpke et D. Schnack. 1989. Computer-aided approaches to identification of aquatic organisms : the use of Expert Systems. Fishbyte 7(2) : 18-19.

Froese, R., I. Achenbach et C. Papasissi 1990. Computer-aided approaches to identification. III. (Conclusion). Modern databases. Fishbyte 8(2) : 25-27.

Rankine, P.W. and R.S. Bailey. 1987. A report on the ICES herring larval surveys in the North Sea and adjacent waters in 1986/1987. ICES C.M. 1987/H : 10, 15 p.

Rainer Froese

La table EGGS

Les œufs de poissons présentent une étonnante variété de couleurs, de conformations, d'appendices, de tailles et de milieux de développement. La table EGGS essaie de standardiser ces informations pour faciliter leur identification ainsi que les études comparatives.

Les champs

La table EGGS contient les Paramètres environnementaux (Environmental parameters) auxquels sont généralement associés l'observation des œufs, comme la Température (Temperature), la Profondeur (Depth) sous forme d'un intervalle, la Salinité (Salinity), le pH (pH), et la teneur en Oxygène (Oxygen) de l'eau. Remarques (Remarks) contient toute information complémentaire sur l'environnement.

Milieu de développement (Place of development) : Parmi les choix suivants : buoyant (pelagic) [flottant (pélagique)] ; on the bottom (demersal) [sur le fond (démersal)] ; fixed on plant or stone [attaché à une plante ou un caillou] ; in sand or gravel [dans le sable ou le gravier] ; in open nest [dans un nid ouvert] ; in covered nest (i.e., burrow or tunnel) [en nid couvert (dans un terrier ou un tunnel)] ; in bubble nest [dans un nid en mousse de mucus] ; in mouth (mouthbrooders) [dans la bouche (incubateur buccal)] ; attached to parental body [attaché au corps parental] ; in brood pouch [en poche incubatrice] ; in female (livebearers) [dans la femelle (vivipares)] ; outside the water [à l'extérieur de l'eau] ; in another animal (i.e., bivalve) [dans un autre animal (bivalve)] ; other [autre].

Shape of egg [forme de l'œuf] : parmi les choix suivants : spherical [sphérique] ; ovoid [ovoïde] ; elongated [étiré] ; other [autre].

Attributes [attributs] : Parmi les choix suivants : smooth [lisse] ; sculptured [sculpté] ; with filaments [avec des filaments] ; with tendrils [avec des vrilles] ; with stalk [avec un pédicule] ; in jelly matrix [dans une matrice de gelée] ; other [autre]. De plus, les œufs peuvent être collants ou non collants.

Color of eggs [couleur des œufs] : Parmi les choix suivants : transparent [transparent] ; white [blanc] ; yellow, orange, amber [jaune, orange, ambre] ; brown, black, gray [marron, noir, gris] ; green [vert] ; other [autre].

Color of oil globule(s) [couleur du(es) globule(s) d'huile] Parmi les choix suivants : yellow [jaune] ; orange/red [orange/rouge] ; green [vert] ; other [autre].

Number of oil globules [nombre de globules d'huile] et leur Diameter [diamètre], Egg diameter [diamètre d'œuf] : Sous forme d'intervalles.

Perivitelline width [largeur du périvitellin] et Chorion thickness [épaisseur du chorion] : Deux caractères d'identification supplémentaires, qui peuvent être indiqués en pourcentage d'un Reference diameter [diamètre de référence].

Additional characters [caractères supplémentaires] : Contient toute information supplémentaire utile à l'identification.

Statut

La table EGGS contient des données sur plus de 250 espèces, principalement de l'Atlantique Nord et de la Méditerranée, extraites de plus de 200 références, entre autres Russell (1976), Fahay (1983) et Moser et al. (1984). Aucun contrôle sérieux n'a été fait jusqu'à présent. Il est donc vraisemblable que la table contienne des erreurs. Nous aimerions augmenter le nombre d'enregistrements de manière importante (voir l'introduction du chapitre ‹ Ichtyoplancton › ci-dessus).

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Biology dans la vue SPECIES, puis sur le bouton Reproduction dans la vue BIOLOGY et sur le bouton Eggs dans la fenêtre REPRODUCTION.

Références

Fahay, M. 1983. Guide to the stages of marine fishes occurring in the Western North Atlantic, Cape Hatteras to the Southern Scotian shelf. J. Northwest Atlantic Fish. Sci. 4, 423 p.

Moser, H.G., W.J. Richards, D.M. Cohen, M.P. Fahay, A.W. Kendall, et S.L. Richardson, Éditeurs. 1984. Ontogeny and systematics of fishes. Am. Soc. Ichthyol. Herpetol. Spec. Publ. 1, 760 p.

Russell, F.S. 1976. The eggs and planktonic stages of British marine fishes. Academic Press, London. 524 p.

Rainer Froese

La table EGGDEV

Que les œufs de poissons se développent plus rapidement à haute qu'à basse température est au moins connu depuis Dannevig (1895), et ce thème a été développé - et quantifié - par de nombreux auteurs (voir Pauly et Pullin 1988, et Fig. 40). L'effet des facteurs autres que la température sur le développement des œufs a été moins étudié : aucun ensemble de données n'est actuellement disponible (en dehors de FishBase) pour identifier clairement ces facteurs et pour quantifier leurs effets pour un grand nombre d'espèces de poissons. La seule exception est la taille des œufs, généralement exprimée par leur diamètre.

Plusieurs auteurs ont noté que les grands œufs se développent, toutes choses étant égales par ailleurs, plus lentement que les petits œufs (voir par exemple Breder et Rosen 1966). Cependant, Pauly et Pullin (1988) ont fourni ce qui était peut-être la première démonstration de cet effet sur de nombreuses espèces, grâce à la compilation des durées de développement, des diamètres et des températures correspondantes pour les œufs de 84 espèces de téléostéens extraits de 50 références. Cette compilation a constitué la base de la table EGGDEV.

Les champs

Egg development time [Temps de développement de l'œuf] : Indique la durée entre la ponte/fécondation et l'éclosion, en jours ; idéalement, cette durée devrait faire référence au temps pour lequel 50 % des œufs sont éclos, mais fait souvent référence au milieu d'une gamme.

Egg diameter [Diamètre de l'œuf] : En mm ; il devrait être remplacé par le diamètre d'une sphère équivalente au volume des œufs qui sont non-sphériques comme chez les Engraulidae par exemple.

Water temperature [Température de l'eau] : Indique la température moyenne en °C à laquelle les œufs ont été exposés.

Salinity [Salinité] : Indique en ‰ la valeur et le type de salinité parmi les choix suivants : seawater [eau de mer] ; brackish water [eau saumâtre] ; et freshwater [eau douce].

Data type [Type de données] : Parmi les choix suivants : based on field data [d'après des données de terrain] ; based on laboratory experiments [d'après des expériences de laboratoire] ; based on aquarium observations [d'après des observations en aquarium ] ; other [autre].

Remarks [Remarques] : Contient toute information supplémentaire, par exemple sur le diamètre-équivalent sphérique, ou sur le type d'acquisition des données.

Reference [Référence], Locality [Localité] et Country [Pays] : Voir les tables précédentes.

Utilisations

Pauly et Pullin (1988) ont proposé un modèle (log linéaire) de régression multiple pour prédire la durée de développement de l'œuf connaissant la température de l'eau et le diamètre de l'œuf. Grâce à l'ensemble des données aujourd'hui augmenté dans la table EGGDEV, ce modèle peut évidemment être amélioré. Par exemple, en incluant éventuellement des variables établies pour forcer les groupements taxinomiques, il serait possible de tester l'assertion de Pauly et Pullin selon laquelle la durée de développement des œufs ne dépend pas de la position taxinomique des espèces, à température et diamètre égaux. Le test de cette hypothèse peut avoir des implications importantes sur les théories biologiques.

De plus, la taille et la durée de développement des œufs sont des informations très importantes pour tous les élevages de poissons car elles peuvent influencer l'agencement des écloseries et la gestion aquacole durant toutes les phases du cycle de vie en captivité.

Les petits œufs produisent des petites larves avec des petites bouches qui sont souvent plus difficiles à nourrir que les grandes larves. Par conséquent, la table EGGDEV peut fournir des indices sur les exigences et les succès possibles d'une reproduction en captivité. C'est important pour les nouvelles espèces considérées comme potentielles pour l'aquaculture.

Fig. 40. Durée de développement moyenne des œufs de poissons en fonction de la température moyenne de l'eau dans laquelle ils se sont développés et de leur diamètre. Voir Encadré 27 pour une interprétation de ce graphique.

Fig. 41. Durée de développement des œufs de poissons ajustée à la température en fonction de leur diamètre. Voir Encadré 27 pour une interprétation de ce graphique.

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Biology dans la vue SPECIES, puis sur le bouton Reproduction dans la vue BIOLOGY. et sur le bouton Egg dev. dans la fenêtre REPRODUCTION. Double-cliquer sur une des lignes dans la vue LIST OF EGG DEVELOPMENT TIMES affiche les informations relatives au développement désigné.

Références

Breder, C.M., Jr. et D.E. Rosen. 1966. Modes of reproduction in fishes. T.F.H. Publications, Neptune City. 941 p.

Dannevig, H. 1895. The influence of temperature on the development of the eggs of fishes. Rep. Fish. Board Scotland 1894 : 147-152.

Pauly, D. et R.S.V. Pullin. 1988. Hatching time in spherical, pelagic, marine fish eggs in response to temperature and egg size. Environ. Biol. Fish. 22(4) : 261-271.

Daniel Pauly et Roger S.V. Pullin

La table LARVAE

Les caractères morphologiques des larves de poissons, ainsi que leur niche écologique, changent radicalement au cours du développement larvaire, la période comprise entre l'éclosion et la métamorphose. C'est vrai pour les proportions du corps aussi bien que pour la pigmentation. Les épines, les dents et les rayons des nageoires commencent à apparaître vers la moitié du développement larvaire. Une telle variabilité rend l'identification d'une larve de poisson très difficile.

Froese (1990) a développé et comparé différentes méthodes informatisées pour l'identification des larves de poissons : la taxinomie numérique, les systèmes experts et les bases de données relationnelles. Il en a conclu que globalement, l'approche des bases de données était la plus facile à appliquer et à utiliser, parce que la plupart des larves pouvaient être identifiées par une combinaison restreinte de caractères (voir aussi Froese 1988, 1989 ; Froese et al. 1989, 1990 ; Froese et Papasissi 1990).

Sources

La table LARVAE contient des données sur plus de 300 espèces, principalement de l'Atlantique Nord et de la Méditerranée, extraites de plus de 300 références, entre autres d'Ancona (1956), Russell (1976), Fahay (1983), Moser et al. (1984) et Halbeisen (1988). Il est prévu d'inclure les nombreuses publications récentes sur les larves de poissons, mais voir supra l'introduction du chapitre ‹ Ichtyoplancton › concernant LarvalBase et ses collaborateurs potentiels.

Les champs

Pour les post-larves (c'est-à-dire les larves dans une phase de développement entre la résorption totale du sac vitellin et la métamorphose), la table comprend les champs suivants : Length at first feeding [Longueur à la 1ère alimentation] ; Months [Mois], le mois de l'année d'apparition des larves ; les paramètres usuels de l'eau : Depth [Profondeur] ; Temperature [Température] ; Salinity [Salinité] ; Oxygen [Oxygène], en concentration.

À cause de leur variabilité, de nombreux caractères, méristiques et morphométriques, sont indiqués sous forme d'un intervalle des phases ‹ précoces › aux phases ‹ tardives ›.

Pour les caractères descriptifs, la table intègre des Striking features [Caractéristiques remarquables] comme ‹ les yeux pédonculés › ou ‹ un museau en forme de tube ›, et des Striking shape [Formes remarquables] comme ‹ en forme d'anguille › ou ‹ en forme de têtard ›. Car ces caractéristiques étant rares, elles réduisent drastiquement le nombre d'espèces possibles au cours d'un processus d'identification.

Shape of gut [Conformation de l'intestin] : Caractère également distinctif, parmi les choix suivants : triangular [triangulaire] ; spherical or looped [sphérique ou en boucle] ; elongated [étiré] ; tube-like [en forme de tube] ; aberrant [aberrant].

Gas bladder [Vessie gaseuse] : Parmi les champs suivants : visible [visible] ; invisible [invisible] ; pigmented [pigmentée].

Spinal armature [Épines] : Indique l'emplacement d'épines à divers endroits sur la tête.

Rows on tail [Rangées sur la queue] : Indique l'emplacement de mélanophores parmi les choix suivants : dorsal row [Rangée dorsale] ; ventral row [Rangée ventrale] ; lateral row [Rangée latérale] ; dorsal + ventral row [Rangée dorsale + ventrale] ; dorsal + lateral row [Rangée dorsale + latérale] ; ventral + lateral row [Rangée ventrale + latérale] ; dorsal + lateral + ventral row [Rangée dorsale + latérale + ventrale] ; no rows [Aucune rangée]. Il a été montré que ces motifs de pigmentation sont des caractères très efficaces pour identifier les larves de poissons (Halbeisen 1988 ; Froese 1990).

Other melanophores [Autres mélanophores] : Indique en deux champs l'emplacement de mélanophores supplémentaires sur la queue et la présence de mélanophores sur la tête et le tronc.

Urostyle region [région de l'urostyle] et Peritoneum [Péritoine] peuvent être pigmentés ; Pectorals [Pectorales] et Pelvics [Pelviennes] peuvent être absentes ou avoir des formes remarquables, avec ou sans mélanophores.

Meristic characters [Caractères méristiques] : Indique le nombre total et préanal des myomères ou des vertèbres.

Additional characters of postlarvae [Caractères supplémentaires] : Contient tout caractère supplémentaire sur les post-larves.

Enfin, la table LARVAE comprend des champs qui contiennent des caractères métriques pour 3 phases post-larvaires, précoce, flexion et tardive, rapportés à une Reference length [Longueur de référence] : Preanal length [Longueur préanale], Prepectoral length [Longueur prépectorale], Preorbital length [Longueur préorbitale], Diameter of eye [Diamètre de l'œil], Depth at eye [Hauteur du corps au niveau de l'œil], Depth at pectorals [Hauteur du corps au niveau des pectorales], Depth at anus [Hauteur du corps au niveau de l'anus].

Pour la larve vésiculée (avec le sac vitellin non résorbé), la table comprend les champs suivants : Larval area [Aire larvaire] : Indique l'aire de répartition géographique typique des larves ; Place of development [Milieu de développement] : Voir la table EGGS pour la liste des choix ; Length at birth [Longueur à la naissance] ; Preanal length [Longueur préanale] : en pourcentage de la longueur totale ; Yolk-sac [Sac vitellin] : deux champs indiquent sa forme et sa pigmentation ; Yolk [Vitellus] : indique sa consistance ; Oil globules [Globules huileux] : trois champs indiquent leur nombre, position et pigmentation dans le vitellus.

Trois champs décrivent la pigmentation des larves vésiculées sur la tête, le tronc et la queue parmi les modèles observés les plus communs. Cette description est une information essentielle à des fins d'identification. Additional characters [Caractères supplémentaires] : Contient tout caractère supplémentaire sur les larves vésiculées.

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Biology dans la vue SPECIES, puis sur le bouton Reproduction dans la vue BIOLOGY et sur le bouton Larvae dans la fenêtre REPRODUCTION.

Remerciements

Je rend hommage à la contribution de feu Hans-Wilhelm Halbeisen qui a montré que les modèles de pigmentation chez les larves de poissons peuvent être classifiées. Il a développé, en se fondant sur cette découverte, la première clef d'identification concise des larves de poissons pour une grande zone. De nombreuses illustrations de larves dans FishBase sont tirées des illustrations de sa clef (Halbeisen 1988). Je remercie aussi Wolfgang Welsch pour son aide à la numérisation de nombreuses illustrations de larves. Enfin, je remercie Christine Papasissi qui a effectué de nombreuses mesures pour la partie morphométrie de la table LARVAE.

Références

d'Ancona, U. 1956. Uova larve e stadi giovanili di Teleostei. Ordine Synentognathi, Famiglia 1 : Scomberesocidae. Fauna Flora Golfo Napoli, Monogr. 38 : 157-164.

Fahay, M. 1983. Guide to the stages of marine fishes occurring in the Western North Atlantic, Cape Hatteras to the Southern Scotian shelf. J. Northwest Atlantic Fish. Sci. 4, 423 p.

Froese, R. 1988. The use of quadratic discriminant functions in connection with video-based measurements for identification of fish larvae. ICES C.M. 1988/L : 11, 8 p.

Froese, R. 1989. Computer-aided approaches to identification. II. Numerical taxonomy. Fishbyte 7(3) : 25-28.

Froese, R. 1990. Moderne Methoden zur Bestimmung von Fischlarven. Universität Hamburg. Thèse de Doctorat. 260 p.

Froese, R., W. Schöfer, A. Röpke et D. Schnack. 1989. Computer-aided approaches to identification of aquatic organisms : the use of Expert Systems. Fishbyte 7(2) : 18-19.

Froese, R., I. Achenbach et C. Papasissi. 1990. Computer-aided approaches to identification. III. (Conclusion). Modern databases. Fishbyte 8(2) : 25-27.

Froese, R. et C. Papasissi. 1990. The use of modern relational databases for identification of fish larvae. J. Appl. Ichthyol. 6 : 37-45.

Halbeisen, H-W. 1988. Bestimmungschlüssel für Fische der Nordsee und angrenzender Gebiete. Ber. Inst. Meereskd. 178, 76 p.

Moser, H.G., W.J. Richards, D.M. Cohen, M.P. Fahay, A.W. Kendall, et S.L. Richardson, Éditeurs. 1984. Ontogeny and systematics of fishes. Am. Soc. Ichthyol. Herpetol. Spec. Publ. 1, 760 p.

Russell, F.S. 1976. The eggs and planktonic stages of British marine fishes. Academic Press, London, 524 p.

Rainer Froese

La table LARVDYN de Houde et Zastrow

La table LARVDYN a été développée par Edward D. Houde et Colleen E. Zastrow (1993) qui l'a fournie à FishBase pour étendre sa diffusion. Nous citons leur publication (p. 290) :

« Les taux de croissance et de mortalité, et les bilans énergétiques des larves de poissons diffèrent selon les espèces et les écosystèmes. Dans cette synthèse, nous avons évalué les taux d'ingestion requis pour une croissance moyenne des larves, et développé des bilans énergétiques. Le taux de croissance spécifique (en poids ; G) ; le taux de mortalité totale (Z) ; la durée de la phase larvaire (D) ; l'efficacité de conversion alimentaire (K1) ; et la consommation d'oxygène spécifique (QO2) ont été obtenus de la littérature et regroupés par espèce d'eau douce ou marine. […] Une analyse de covariance a été utilisée pour permettre la comparaison des valeurs moyennes entre écosystèmes et taxa. »

La table contient des données pour environ 100 espèces extraites de plus de 200 références. Ces informations sont utilisées pour produire différents types de graphiques. La Fig. 42 en est une illustration. Nous projetons d'étendre cette couverture au fur et à mesure que de nouvelles informations deviendront disponibles. Données et questions des utilisateurs de FishBase seront appréciées.

Fig. 42. Mortalité en fonction du taux de croissance chez les larves. Points clairs : toutes les espèces dans FishBase ; point noir : Clupea harengus.

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Biology dans la vue SPECIES, puis sur le bouton Reproduction dans la vue BIOLOGY et sur le bouton Larval dyn. dans la fenêtre REPRODUCTION.

Référence

Houde, E.D. et C.E. Zastrow. 1993. Ecosystem- and taxon-specific dynamic energetics properties of fish larvae assemblages. Bull. Mar. Sci. 53(2) : 290-335.

Rainer Froese